Surveillance du COVID-19 à partir du 1er juillet 2023

Santé Publique France - Juillet 2023

Depuis l’émergence du COVID-19 il y a plus de trois ans, la surveillance épidémiologique de Santé publique France repose sur un dispositif multi-sources qui a permis de produire de manière réactive de nombreux indicateurs de suivi de l’épidémie. A partir du 1er juillet 2023, plusieurs systèmes d’information évoluent. Ces changements interviennent dans un contexte épidémique favorable, marqué par une très faible circulation virale en France hexagonale et en Outre-mer.

Une évolution des systèmes d’information

La loi n°2022-1089 du 30 Juillet 2022 mettant fin aux régimes d’exception pour lutter contre l’épidémie de COVID-19 prévoit l’arrêt du traitement des données personnelles issues du système d’information du dépistage (SI-DEP) basé sur les résultats de tests RT-PCR et tests antigéniques. Les indicateurs issus de cette source (nombres de cas quotidiens, taux de dépistage, taux de positivité, R effectif) ne pourront plus être produits. L’historique de ces indicateurs restera accessible via Géodes et data.gouv.fr. Les consignes spécifiques de saisie dans le système d’information des victimes (SI-VIC), pour la surveillance hospitalière des patients atteints du COVID-19 sont levées à compter du vendredi 30 juin. En conséquence, les indicateurs hospitaliers issus de cette source ne seront plus disponibles.

Une surveillance qui s’adapte

Le COVID-19 nécessite le maintien d’une surveillance épidémiologique particulière au niveau national, au même titre que d’autres maladies. Pour cette raison, des solutions alternatives sont mises en place pour assurer la continuité de la production d’indicateurs épidémiologiques. Durant une période transitoire, les indicateurs de surveillance virologiques issus de cette source ne seront pas disponibles, mais ils seront par la suite publiés à une fréquence hebdomadaire aux niveaux national, régional et départemental.

L’historique des indicateurs issus de SI-DEP resteront accessibles sur notre plateforme Géodes et sur data.gouv.fr, de même que les nouveaux indicateurs à une fréquence hebdomadaire. Le tableau de bord InfoCovidFrance, notamment alimenté à partir des bases de données SI-DEP et SI-VIC, ne sera plus actualisé à partir du 1er juillet 2023.

Le suivi de l’épidémie est maintenu et s’appuiera sur le dispositif multi-sources qui comprend toujours :

  • La surveillance syndromique SurSaUD®, constituée des indicateurs des recours aux associations SOS Médecins pour les soins de ville, des urgences hospitalières (réseau OSCOUR®) et de mortalité (décès toutes causes de l’Insee et issues de la certification électronique du CepiDC).
  • La surveillance génomique réalisée par le consortium Emergen via la réalisation hebdomadaire des enquêtes Flash, qui permet d’identifier de manière réactive l’émergence de nouveau variant pouvant avoir un impact en termes de santé publique.

Les indicateurs issus de ces surveillances seront publiés à une fréquence hebdomadaire pour les bulletins SurSaUD et mensuelle pour les analyses de risques pour les variants sur le site de Santé publique France :

Ces évolutions s’inscrivent in fine dans une démarche de normalisation de la surveillance de la COVID-19 et de son intégration progressive parmi les épidémies respiratoires suivies en routine. Cette stratégie de surveillance intégrée des infections respiratoires aiguës propose une approche globale des pathologies respiratoires aiguës dont les principales sont la COVID-19, la grippe et la bronchiolite. Elle sera pleinement déployée pour le début de la saison 2023-2024 et fera l’objet d’une information spécifique en amont de sa mise en œuvre. (Résumé éditeur)

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